Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms