Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIRIP3Q9BW71 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIRIP3Q9BW71 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms