Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KATNB1Q9BVA0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms