Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2AFJQ9BTM1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2AFJQ9BTM1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2AFJQ9BTM1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2AFJQ9BTM1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2AFJQ9BTM1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2AFJQ9BTM1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2AFJQ9BTM1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2AFJQ9BTM1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms