Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COPS4Q9BT78 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COPS4Q9BT78 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms