Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GINS3Q9BRX5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GINS3Q9BRX5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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