Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MESP1Q9BRJ9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MESP1Q9BRJ9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms