Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms