Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USB1Q9BQ65 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms