Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
COPS8Q99627 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms