Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCNX1Q96RV3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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