Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms