Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSNARE1Q96NA8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms