Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RNFT2Q96EX2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNFT2Q96EX2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms