Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms