Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CAVIN3Q969G5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms