Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR2Q969E8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms