Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAD50Q92878 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms