Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRUQ92729 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRUQ92729 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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