Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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C15orf40Q8WUR7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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C15orf40Q8WUR7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C15orf40Q8WUR7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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