Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
FAT3Q8TDW7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms