Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX54Q8TDD1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms