Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEMA6DQ8NFY4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEMA6DQ8NFY4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms