Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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TMIEQ8NEW7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMIEQ8NEW7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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