Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC112Q8NEF3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms