Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00301Q8NCQ3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00301Q8NCQ3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms