Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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DTX3Q8N9I9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX3Q8N9I9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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