Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC117Q8IWD4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms