Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC84Q86UT8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms