Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms