Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC46A3Q7Z3Q1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms