Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRCQ7RTU9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms