Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
BHLHA9Q7RTU4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms