Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPOCD1Q6ZMY3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms