Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00114Q6XXX2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00114Q6XXX2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms