Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMARCD3Q6STE5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms