Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RWDD4Q6NW29 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RWDD4Q6NW29 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms