Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRNP1Q6NT89 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRNP1Q6NT89 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms