Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYOM3Q5VTT5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYOM3Q5VTT5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms