Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRPF38BQ5VTL8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms