Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms