Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms