Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00303Q3SY05 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms