Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT24Q2M2I5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT24Q2M2I5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms