Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF4Q2M2E3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms