Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RTL8BQ17RB0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RTL8BQ17RB0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RTL8BQ17RB0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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