Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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RTN1Q16799 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RTN1Q16799 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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