Protein–RNA interactions for Protein: Q16678

CYP1B1, Cytochrome P450 1B1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP1B1Q16678 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CYP1B1Q16678 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms