Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms