Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNXAQ16473 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms